DSSPのバイナリファイルをゲットする。
DSSPとは、タンパク質の立体構造に基づいて、その二次構造を出力するアルゴリズムです。同名でプログラムも存在します。プログラムをダウンロードして使う場合と、DSSPが出力したバイナリファイル(PDBに登録しているタンパク質については、DSSPが出力したバイナリファイルがすでにある)を使う場合の二つに分かれます。今回はバイナリファイルを直接ゲットしました(4Gくらい…)。
rsync -avz rsync://rsync.cmbi.ru.nl/dssp/ /path_to_dssp/
詳しくは下記のURLをご参考にください。前時代的なホームページですが、我慢してください。
参考URL:http://swift.cmbi.ru.nl/gv/dssp/