おいも貴婦人ブログ

生物系博士課程満期退学をしたAIエンジニアのブログ。

VMD

PDBのタンパク質構造を描画するためのソフトウェアまとめ。

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Protein Data Bank(PDB)は生物物理屋さんにとっては、お馴染みのデータベースです。その名の通り、タンパク質の立体構造のデータが収められています。データだけ見ていても仕方がないので、そのデータを可視化するソフトウェアが必要になります。人気なとこ…

VMDで壁みないなものを描写してみる。

VMD

こんにちわ。おいもです。今回はVMDで壁みたいなもの描写してみようと思います。壁を描写するのではなく、点の集合を壁のように見せる方法です。壁を直接描写する方法があれば教えてください。私の方法では、tkコンソールを使います。VMDを開いた後に[Extens…