おいも貴婦人ブログ

生物系博士課程満期退学をしたAIエンジニアのブログ。

MARTINI

Martini(粗視化)力場を用いた計算(チュートリアル)

http://cgmartini.nl/cgmartini/ Martini 力場は分子動力学計算のための粗視化力場です。平均的に、4つの重原子を1つの粒子に置き換えます。この力場はシステマティックに決められて、極性と非極性の多くの化学複合体における自由エネルギー分割の再現に基づ…