おいも貴婦人ブログ

生物系博士課程満期退学をしたAIエンジニアのブログ。

BJ(ウィルスキャプシドの動力学の局所的なルールのシミュレーション)

以下に書いたものは、論文を基にした私の理解なので、正確性を欠きます。正確な情報を知りたい場合は、下記の論文を参照してください。また、下記の論文の図を参照することで、理解が深まると思います。

Local Rules Simulation of the Kinetics of Virus Capsid Self-Assembly(1998)

要約
  • 1994にBergerらによって提唱されたlocal rules theory に基づいたシミュレーションをした。
  • この理論はウィルスのアセンブリの比較的に多くの特徴を維持したまま、MDみたいなシミュレーションをすることを保証する。
  • 結合エネルギー、結合ミスにおける寛容性やサブユニットの濃度に基づくキャプシドの成長率がlocal rules theoryに基づくmodelの使用を説明する。
  • 実験により、成長率とアセンブリの信頼性のトレードオフが存在することを示した。