PNAS(複雑なタンパク質であるadenylate kinaseと2out-knotの複数のフォールディング経路とエネルギー表面）
以下に書いたものは、論文を基にした私の理解なので、正確性を欠きます。正確な情報を知りたい場合は、下記の論文を参照してください。また、下記の論文の図を参照することで、理解が深まると思います。
Energy landscape and multiroute folding of topologically complex proteins adenylate kinase and 2ouf-knot(2012)
要約
- 大きいたんぱく質や遅いフォールディングに関する研究は多くない。
- エネルギーランダスケープ理論が、遅いフォールディングにどのように適用できるか調べた。
- 以前開発したAtomic-interaction based coarse grained (AICG)モデルにタンパク質の柔らかさを加えた新しいモデルを作った。
- 新しいモデルをマルチドメインタンパク質であるadenylate kinaseに適用した結果、実験結果とよく一致した。
- 2ouf-knot(結び目があるタンパク質)に適用した結果、96%の確率で結び目のフォールディングを再現できた。
- 結び目を形成するタンパク質は、形成しないタンパク質と比べると、フォールディング速度が非常に遅いことが分かった。
- 2out-knotの結び目を形成しないある状態(substate)は、backtrcaking mechanismを支持している。
