おいも貴婦人ブログ

生物系博士課程満期退学をしたAIエンジニアのブログ。

2015-10-08から1日間の記事一覧

Gromacsの解析にMDAnalysisを使ってみよう。

gromacsの計算結果から、MDAnalysisを使ってRMSFを求めてみる。非常に簡単!!! #!/usr/bin/env python import MDAnalysis from MDAnalysis.analysis.rms import RMSF topology='md_0_1.gro' ## PSF,CRD,PDB,GRO trajectory='md_0_1.trr' ## DCD,XTC/TRR unive…

Djangoでアプリを作成する際のバグについて

django-admin.py startapp mysite を実行して、以下のようなエラーが出る場合。 Traceback (most recent call last): File "/home/vagrant/.virtualenvs/py27/bin/django-admin.py", line 5, in <module> management.execute_from_command_line() File "/home/vagran</module>…